Le Conseil des Rats Discussions autour du rat domestique: santé, alimentation, comportement, adoption...

Un sujet a été posté mais il est verrouillé.
/leconseildesrats/genetique-du-rat-f17/consanguinite-rat-t3459.html?hilit=consanguin#p42267

J'aimerais ajouter ce lien très instructif (des connaissances en médecine sont un plus pour la compréhension mais c'est très abordable pour le profane)
http://ratlala.free.fr/lerat/articles/consanguin.html#cons_nat

Je ne veux pas créer une polémique. Je tiens juste à dire que les avis sont très controversés concernant les "éventuels risques ou avantages" et c'est à chacun d'avoir son avis parce qu'au fonds, tout le monde a raison d'être pour ou contre (après avoir potassé toute la soirée).
En ce qui me concerne et pour résumer (je ne vais pas remettre tous les avis, témoignages et info que j'ai lu !), je pense que lorsque 1 mâle et une 1 femelle de même famille ont des petits, ces derniers n'auront pas forcément de problèmes plus graves que ceux qui sont issus de parents non consanguins. Bien sûr, ça peut multiplier les "chances" de tares mais autant que les "bons gênes" dans le caractère ou autre...
----
Perso, je n'ai pas fait exprès d'acheter une rate pleine issue d'une animalerie, je ne joue pas à faire des croisements choisis pour reproduire des couleurs ou autres et je pense que c'est pareil pour les particuliers de manière générale.
Je pense juste qu'il est préférable de ne pas multiplier les consanguinités à "répétitions outrancières" (désolée du pléonasme mais ça me semble plus clair ainsi), histoire de renouveller le patrimoine génétique.
----
Je me suis interrogée juste sur cela :
- Concernant les témoignages qui sont contre la consanguinité suite à divers maladies : y'a t-il eu des statistiques réalisées en comparaison avec des rats malades non issus de lignée consanguine ??? Peut-être que c'est pareil mais plus discret car pas de "cause directe sur laquelle s'appuyer" du genre "il est consanguin donc c'est pour ça qu'il est malade" : un peu facile non ? Il peut aussi y avoir un vilain gêne sur une portée non consanguine.

- Des chercheurs se sont-ils penchés sur l'ADN de nos rats sauvages par rapport à leur consanguinité (évidemment massivement présente) ? Je ne suis pas certaine que la vie des rats sauvages passionnent l'humanité (sauf pour nous hein) à part pour les dératiseurs (c'est un autre sujet, oups !).

- Les rats malades accusés de leur "mauvaise généalogie" sont-ils nés dans de bonnes conditions ?
Pour des cas isolés, par exemple, un rat qui éternue trop, avec des problèmes respiratoires n'aurait-il pas développer une allergie durant ses premiers pas (qu'il soit consanguins ou pas) ou bien il réagit à la fumée de cigarettes, aux gaz des pots d'échappement du parking sous la fenêtre proche de la cage, aux produits détergents ?
Autre situation : un rat n'aurait-il pas mangé trop de chocolat noir (interdit !) que le pote a foutu discrétos dans la cage en pensant "bien faire" ?
Y'a t-il des courants d'air dans la maison ? Des humains sont-ils venus et ont refilé leurs miasmes ? De la litière infectée de bactéries ou parasites ? Et selon la maladie, l'humain n'aurait-il pas une part de responsabilité avouée ou non, lui ou son environnement ? En vrai le débat n'est pas là mais il est CERTAIN que des rats non consanguins ont "autant" de soucis que les autres mais c'est moins remarqué.

Concernant les cancers, n'oublions pas Tchernobyl (pas que hein) et cela n'a pas affecté que les humains et ce - encore pour de nombreuses années de répercussion - sur l'eau, la nourriture (le pire de tout : les champignons !!! - m'en fiche, j'aime pas ça lol). Je ne crois pas que l'on dise des humains qu'ils ont des cancers à cause de la consanguinité, pourtant les cas augmentent constamment. Après, comme on dit, y'a des facteurs génétiques, des facteurs aggravants et des facteurs encore inconnus du "public" et même des initiés en médecine/recherche sur le pourquoi du comment, à bon entendeur ;)
----
En bref, "pour ou contre" la consanguinité chez le rat domestique, inévitable chez le rat sauvage, chacun voit midi à sa porte, le tout est de bien sélectionner diverses sources d'informations, de rester ouvert et de faire la part des choses selon sa culture personnelle

Bonjour. Bon on va y aller point par point.

Premièrement la consanguinité en elle même. On parle de reproduction entre individus proches génétiquement. Une reproduction de ce type réduit le taux d'hétérozygotie chez les descendants et par la même la diversité génétique. les probabilités de tares et de "bons gènes n'augmentes pas de la même manière. La plupart des gènes fonctionnant correctement avec une seule copie fonctionnelle. Considérons un croisement ne portant que sur un gène avec un animal sain (A)(A) et second porteur sur un gène d'un allèle muté (a). Aucun probléme pour lui, l’allèle sain(A) donc il est porteur suffit à assurer la fonction.

En F1 tu as 50% de petits (A)(A) et 50% de petits (A)(a)

En F2 on obtient 9/16 de sains, 6/16 d'hétérozygotes et 1/16 de tarés. Ce n'est pas bien important à première vue. Et c'est possiblement le cas. Si la tare n'est pas handicapante pour l'animal par exemple (albinos, siamois, nu, sont peu gênants pour un rat en cage). Si la population d'origine présentait déjà une prévalence de l’allèle muté semblable rien de bien grave non plus, tu ne change pas la donne.
Mais dans la plupart des cas les allèles mutants délétères ont des prévalences basses, aussi un individu apparié au hasard aura une chance très faible d'être porteur des mêmes mutations que son partenaire et les petits issus de leur reproduction seront surement porteurs de mutations transmises par un des parents sur certains mais aussi d'une version fonctionnelle de ce gène venant de l'autre parent c'est la cas de notre F1. Au contraire deux individus proches ont des chances accrues de porter les mêmes mutations et donc de transmettre celles-ci sous forme hétérozygotes à leurs descendants c'est le cas de notre F2. A répéter sur les 25-30k gènes du rat. Une tare seule n'est pas forcément très grave, ni même visible, on pense tout de suites aux malformations ou aux tares létales, mais une anosmie partielle, une fonction enzymatique bloquée, une incapacité à synthétiser une vitamine, une mauvaise vision, une thermorégulation moins efficace sont autant de cas qui pourront ne devenir gênant que lors d'un événement exceptionnel .

Maintenant la consanguinité des rats sauvages. On parle de rats sauvages, c'est à dire d'une population en croisement libre, des croisement consanguins existent dans des populations de ce type, mais leur probabilité est limité par la taille de la population. La population de rats sauvage c'est plusieurs dizaines de millions de rats au bas mot, avec des flux génétiques favorisés par l'homme grâce aux transport de marchandises et une grande diversité génétique. Donc la consanguinité n'est pas un probléme du tout pour les rats. Les espèces ou populations qui souffrent de la consanguinité sont en effectif très réduits (lions d’Asie, guépard, ours des Pyrénées), ou proviennent d'un effectif de départ très faible (vache Blanc bleu belge, Boa constrictor longicauda en captivité). Pour idée, les populations de loups espagnols et italiens (environ 700 et 2000 individus) ne soufrent pas de désordres liées à la consanguinité.

C'est sur cette perte de diversité que se situe un des autres problèmes posés par la consanguinité. Diminuer la diversité d'une population est très simple et rapide, par contre l'augmenter c'est une autre paire de manches. C'est ce fait qui permet aujourd'hui de savoir que l'humain est passé par un goulot d'étranglement génétique il y a 70k années (15k individus) ou que toutes les vaches domestiques ne descendent que de 80 individus domestiqués il y a 10k années. si de tels événement sont encore visibles à l'heure actuelle sur des populations énormes (1.3 milliards de vaches, 7 d'humains), je vous laisse imaginer la difficulté à rattraper une consanguinité excessive.

Ensuite la fragilité lié au bagage génétique. Il est clairement établi sur les souches de rats de laboratoire que chaque souche a un fond génétique qui favorise certains traits tels que : obésité (lewis, wistar), fragilité pulmonaire (brown norway), fréquence des tumeurs, vigueur du système immunitaire, longévité moyenne, nombre de petits par portée, vitesse de croissance, etc. Donc oui un bagage restreint génétique peut être neutre ou négatif pour la population, mais pas positif à ma connaissance. L'uniformité d'une population augmente aussi sa sensibilité en réduisant la probabilité d'apparition d'individus variants capables de résister à un agent négatif (pathogène, conditions extrêmes, variation dans le milieux, etc). Ainsi il est possible de perdre totalement une souche à faible variabilité génétique avec un événement qui aurait laissé des survivants sur une population possédant une diversité génétique plus grande. L'épidémie spécialement, est à craindre, si le pathogène n'a pas à s'adapter à des différences entre individus et qu'en face tous les individus de la population ont le même niveau de résistance. Un bel exemple pour ça est à voir du coté du pommier dont une pathologie qui peut ruiner une récolte sur une souche ne fait même pas broncher une autre et ces pathologie de façon générale font fort peu de mal à la population mère. Les populations filles (cultivars) n'ont pas hérité de gènes délétères, mais elle ont perdu une partie de la diversité génétique qui donne sa résistance à la population mère. Cette perte est en grande partie aléatoire ce qui explique que toutes n'aient pas les mêmes sensibilités.

La consanguinité en élevage maintenant. Perdre des souches en élevage de laboratoire pour les rats par consanguinité excessive est une chose qui arrive. C'est pour cela qu'il y a des méthodes de conservation des souches visant à limiter au maximum la dégénérescence des souches. Assez similaire à cela il y a les méthodes de retrempe de souche chez les éleveurs de chiens.

Merci beaucoup pour ces très précieuses informations